膜性质：膜过于干燥、白斑、弯曲、表面缓冲液过多等情况，都会影响电泳设备的实际使用结果。
    缓冲溶液组成、pH、离子强度、浓度等因素，同样也会影响电泳设备的使用结果，缓冲液浓度适中，太低，区带泳动速度快，增加区带宽度；过高，使区带移动速度减慢，致使区带不易分离。缓冲液使用次数太多、时间过长也会让浓度发生改变，若膜与缓冲液接触不良，就会影响电泳结果。
    电流和电压：电流太大，影响电泳，高压时，必须安装有效的冷却装置。
    若样品数量过多，起始位置错误，加样失效等情况都会让电泳设备结果失效。同时在气温较高或连续生产过程中，漆液温度明显上升，为保证漆膜质量，必须冷却漆液，可利用循环地下、冷却塔、冷冻机强制冷却。
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